La Facultad de Medicina de la Universidad de Navarra es la tercera de España según el ranking 2015 del diario El Mundo. La clasificación destaca el programa bilingüe del centro académico que ofrece la oportunidad "de cursar prácticas en hospitales de primer nivel internacional en Estados Unidos, Reino Unido o Asia" y su oferta académica, que incluye un título propio en Inmuno Oncología.

A nivel general,  sitúa a la Universidad de Navarra entre las diez primeras de toda España, en concreto, en octava posición, sólo superada por universidades de Madrid y Barcelona. Asimismo, se ha calificado al centro académico como el mejor no estatal de España destacando su orientación a la formación integral en el ámbito académico, cultural y personal subrayando el contacto permanente de los profesores con los cambios y avances y la atención personalizada a los estudiantes.