La Escuela de Enfermeras del Estudio General de Navarra nació en 1954. Las clases comenzaron en la sala de conferencias del Instituto de Higiene (C/ Leyre), un lugar cedido por su director, el Dr. José Viñes, tras un acuerdo con la Diputación.

El primer equipo directivo de la Escuela lo formaron María Casal, la primera directora; María Jesús Domingo, jefa de Enfermeras; y Mariví Tabernero, secretaria. A ellas se unió Sagrario Aguinaga.

Para conseguir alumnas, se puso un anuncio en el periódico para comunicar que se empezaban los estudios de Ayudantes Técnicos Sanitarios Femeninos en el Estudio General de Navarra. Se esperaban unas doce matrículas ese primer año, y se doblaron: fueron 24.

Desde el principio, las estudiantes de Enfermería eran reconocibles por su uniforme. Diseño de Flora Villarreal, destacada modista de Madrid, era de color tabaco (y no blanco, como era habitual). Las rayas en la cofia indicaban el curso de las alumnas.

Pronto se vio la necesidad de contar con más medios: instalaciones y un lugar donde hacer prácticas desde primero. En 1955 las clases de Enfermería (como las de Medicina) se trasladaron a la llamada "Escuela Vieja", un pabellón que estaba en desuso dentro del Hospital de Navarra.

A las primeras asignaturas, Anatomía Funcional y Patología General, se sumaron Biología General, Histología Humana, Microbiología y Parasitología e Higiene General, gracias al refuerzo que supuso la incorporación de la irlandesa Eileen Maher y Ángela Mouriz.

En 1958, médicos y enfermeras se trasladaron a la "Escuela Nueva", primer edificio de la futura Universidad.

La llegada ese año del Dr. Eduardo Ortiz de Landázuri a Medicina supuso, también, un impulso para la Escuela.

En 1960 comenzaron, con Matrona, las especialidades en Enfermería. Después, Cardiología y Cirugía Cardiovascular, Psiquiatría, Fisioterapia, Cirugía Ortopédica y Traumatología, Pediatría, Quirófano, Cuidados Intensivos, Medicina Interna y Análisis Clínicos.

En noviembre de 1961 acabó la construcción de la 1ª fase de la Clínica Universidad de Navarra. Las prácticas de Enfermería se dividieron, entonces, entre esa primera fase, el Pabellón F (cedido unos años antes) y los servicios generales del propio Hospital de Navarra.

En 1968 se creó el papel de la instructora en la Escuela: enfermeras que han estudiando una especialidad y con gran experiencia; que se encargan de la enseñanza práctica de las alumnas, orientándolas desde el punto de vista profesional y personal.

Entre el 29 de noviembre y el 1 de diciembre de 1974 se celebró en la Universidad el I Curso para Personal Docente de Escuelas de Enfermeras. Un encuentro de carácter nacional al que asistieron más de 200 profesionales de toda España.

En 1977, las Escuelas de Enfermería alcanzaron, por fin, en España, el rango universitario. La duración de los estudios se mantuvo en 3 años, pero se aprobó un nuevo Plan de Estudios con asignaturas más afines a la carrera y más prácticas.

En 1989 la Escuela de Enfermería firmó el primer acuerdo con la Universidad de Edimburgo. El convenio permitió la realización de estudios de doctorado, algo que en España todavía no era posible.

El 10 y 11 de marzo de 1995, la todavía Escuela organizó el I Simposio para Estudiantes de Enfermería, que reunió a 375 participantes.

En 2002 comenzó a impartirse en la Escuela la asignatura de Cuidados Paliativos.

En marzo de 2004 Amparo Zaragoza defendió la primera tesis en Enfermería de la Universidad. Lo hizo en Glasgow (Inglaterra) sobre el Proceso de Atención en Enfermería, convirtiéndose en una de las primeras doctoras en esta disciplina en España.

En 2007, se creó en Enfermería la Cátedra María Egea con la finalidad de fomentar la investigación en Enfermería.

En 2007-2008 comenzó el Máster en Ciencias de la Enfermería; en 2010-2011 cambió de nombre a Máster de Investigación y Práctica Avanzada de Enfermería; y en 2013-2014 pasó a ser Máster en Práctica Avanzada y Gestión de Enfermería.

En 2009 la diplomatura se transformó en grado, pasando de 3 a 4 cursos. Los estudios de Enfermería se igualaron al resto de las disciplinas y se hizo posible acceder a estudios de máster y doctorado. Mercedes Díez del Corral era la directora de la Escuela entonces.

En el curso 2010-11, el Ministerio de Educación aprobó el cambio en la denominación de la Escuela, que pasó a llamarse Facultad. La directora se convirtió en decana. La primera fue Mercedes Díez del Corral, que desde 2011 se ha alternado en el cargo con Maribel Saracíbar.

En el curso 2011-2012, la Facultad puso en marcha el Máster en Cuidados Paliativos.

Ese año, también, se aprobó el primer programa de doctorado en Ciencias de la Enfermería. Las primeras tesis comenzaron a defenderse en 2015.

En 2013 se puso en marcha el "International Nursing Program", una apuesta por la internacionalización de la Facultad que ofrece intercambios y prácticas durante el verano.

Desde 2014, la Facultad ofrece también el curso de verano "Nursing Summer School".

En 2016, la Facultad inauguró su Centro de Simulación, una apuesta por la Simulación Clínica Avanzada de Alta Fidelidad como método complementario de aprendizaje y evaluación de los estudiantes.

Este curso 2022-23 ha comenzado a impartirse en el campus de Madrid de la Universidad el Máster en Práctica Avanzada de Enfermería en Oncología. La primera promoción cuenta con 20 estudiantes.